KennyHeadway's miscellaneous notes

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ステルスオミクロン (4)

これもまた、インドの記事であるが、亜種 BA.2系統は感染力が高そうである。PCR検査でCt値30以下をゲノム解析に回すようにしていたとのことであるが、追い付かなくなりそれをやめて海外渡航歴がある人を対象としている。日本でも普通に受けられる医療サービスが制限されてきているが、同じように今までできていたことができなくなる。限られたリソースで何ができるのか、何をやめても大丈夫なのか、そういった考え方を持った方が良いのかと考えされられた。

 

www.news18.com

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コルカタのオミクロン感染者の80%にBA.2「ステルス」変異体が発見され、医師は集団感染を恐れている

コルカタの研究所からゲノム解読のために送られたCovid-19症例のほぼ80%からOmicron変異体の亜系譜であるBA.2が検出され、インドがコロナウイルス症例の急増の渦中にある今、都市生活者の間に不安が広がっています。

このサンプルは12月22日から28日の間にゲノム解読のために送られ、そのうちの80%近くがCT値30以下のBA.2陽性で、高いウイルス量を示していた。

ある検査機関から送られた検体では、34のCovid陽性検体がBA.2であることが判明しました。1検体はオミクロンBA.1、8検体はデルタとデルタプラスであった。別の検査機関から送られた17のCovid陽性サンプルのうち、14はオミクロンでBA.2系統に属し、残りはデルタであった。第3の研究室から送られた50のサンプルについての調査結果では、35がBA.2であった。

TOIの取材に対し、インド化学生物学研究所の免疫学者ディプヤマン・ガングリー氏は、ゲノム配列決定の結果は、コルカタと隣接地域のコミュニティで優勢に循環している亜系がBA.2であることを示している、と述べた。

"BA.2が地域の集団感染を引き起こしている可能性があります。この亜系は他の兄弟とは異なるが、遺伝的には同じ系列に属するため、病気の臨床経過に大きな違いはない」とTOIはDipyaman Gangulyの言葉を引用しています。

AMRIダクリアの微生物学シェリー・シャルマ・ガングリー氏によると、サンプルの約70%がオミクロン陽性で、そのほとんどがBA.2系であり、これは1週間前のことなので、オミクロンの存在は今までに何倍も増えていると思われるとのことである。

12月初め、政府はオミクロンの地域間感染を検出するため、CT値が30以下の陽性検体をすべてゲノム解読に回すことを決定していたが、1週間後、オミクロンの地域間感染が始まっていることが明らかになり、この決定は覆された。

現在、保健省は検査機関に対し、海外渡航歴のある検体のみを送るよう要請している。RN タゴール国際心臓科学研究所微生物学者 Swatilekha バネルジーは、BA.2 サブタイプがより一般的であるという兆候はあるが、彼らは結論を出すためにより大きなサンプル サイズを必要とすることを追加デルタに置き換えられることを確認した

BA.2株は、一般に「ステルスバージョン」と呼ばれ、ゲノム解読によってのみ検出が可能で、オミクロン変異体の亜流の1つであり、現在ではBA.1、BA.2、BA.3の3種類の亜型に分かれています。

マハラシュトラ州などではBA.1が優勢で、Delta型に代わって急速に流行していますが、BA.3はインドではまだ検出されていません。BA.2は最近海外に渡航した人から検出されていますが、BA.1では渡航歴のある人はほとんどいません。

カルヤニの国立生物医学ゲノム研究所(NIBMG)によると、12月最終週に収集されゲノム解読に回されたCovid-19サンプル10個のうち7個がこの「懸念すべき変異型」であることが判明し、2週間足らずでコルカタの人口においてOmicron変異型はDelta型を追い越したとのことです。